Akut multiplex respiratorisk panel PCR
Utförande laboratorium
Mikrobiologiska laboratoriet, Sunderby sjukhus
Remiss
Elektronisk remiss i första hand (VAS-kod PANOLI ) alternativt mikrobiologens pappersremiss.
Provtagning
Använd provtagningsset för Influensa PCR, nasofarynxsvabb, artikel.nr. 25748. Pinnen förs in horisontellt utmed näshålans botten mot bakre svalgväggen och gnuggas/rullas kraftigt mot slemhinnan. Pinnen bryts, efter provtagning, av i transportröret innehållande flytande transportmedium.
Provtagningsmaterial
-
Provtagningsset Influensa för nasopharynxArt.nr: 25748
Provhantering
Provet ska omedelbart transporteras till laboratoriet, alla prover hanteras som akuta. Om nödvändigt kan provet förvaras i kylskåp i max 3 dygn utan att provet förstörs. Behöver inte kyltransporteras.
Svarsrutiner
Analysen utförs dagtid vardagar. Dagtid helger utförs analysen endast på IVA-patienter
kl. 08.00-15.00.
Elektroniskt svar till beställare.
Referensintervall/Beslutsgräns
PÅVISAD / ej påvisad för respektive agens som ingår i analysen.
Indikation
Akut svår luftvägssjukdom, hos patient i behov av inneliggande vård (vid misstanke om virusorsakad eller atypisk pneumoni).
Medicinsk bakgrund/Tolkning
Nukleinsyrapåvisning av följande virus och bakterier:
-
Adenovirus
-
Coronavirus 229E
-
Coronavirus HKU1
-
Coronavirus OC43
-
Coronavirus NL63
-
SARS-CoV-2
-
Metapneumovirus
-
Rhinovirus/Enterovirus
-
Influenza A
-
Influenza B
-
Parainfluenza 1
-
Parainfluenza 2
-
Parainfluenza 3
-
Parainfluenza 4
-
RSV
-
Bordetella pertussis
-
Chlamydophila pneumoniae
-
Mycoplasma pneumoniae
OBS! Vid misstanke på Bordetella pertussis (kikhosta) rekommenderas riktad PCR (på grund av högre känslighet), se Umeås provtagningsanvisning.
OBS! Vid misstanke på Mycoplasma pneumoniae och Chlamydophila pneumoniae rekommenderas i första hand svalgprov, se labhandboken; Mycoplasma pneumoniae och Chlamydophila pneumoniae DNA.
Interferens och felkällor
Negativa resultat kan bero på infektion med patogener som inte detekteras i testet. Positiva resultat utesluter inte saminfektion med andra organismer. Kompletterande odling samt ev. även annan Mycoplasma pneumoniae och Chlamydophila pneumoniae DNA-diagnostik rekommenderas i allmänhet.
Analysmetoden kan inte säga om provet har bra provkvalitet, dvs om provet innehåller tillräckligt med epitelceller, (virus och atypiska bakterier är intracellulära). Dålig provkvalitet kan ge falskt negativa svar. Påvisning av virus med PCR är vanligen begränsat till sjukdomens första 1-2 veckor. Ett svagt
positivt prov med få mikroorganismer kan hamna under detektionsgränsen. Eftersom nukleinsyra kan kvarstå i nasopharynx i flera veckor efter genomgången infektion kan svaret inte användas för att säga något om aktualiteten av påvisade fynd.
Metod
Multiplex realtids-PCR (DNA/RNA) på FilmArray
Ackrediterad
Nej