Faeces PCR och odling, Enteriska bakterier

Utförande laboratorium

Mikrobiologiska laboratoriet, Sunderby sjukhus

Remiss

I Cosmic: Mikrobiologi - Mage/Tarm - Faeces | PCR | Faeces PCR och 
odling, Salmonella, Campylobacter, Shigella, Yersinia, EHEC mfl.
 
Beställare utan tillgång till Cosmic kan använda Klinisk Mikrobiologis pappersremiss.

Analysen omfattar inte EHEC-varianten stx2f, om stark EHEC-misstanke finns, meddela laboratoriet på remissen!

Viktig remissinfo: infektionsort (inhemsk smitta eller utlandssmitta), kliniska data, förekomst av blodiga diarréer, misstänkt smittkälla, eventuell utbrottssituation.

Det görs ej längre bedömning om provet är representativt för tarmfloran, om detta önskas var god ange det på remissen.

Om odling för Yersinia pseudotuberculosis och Aeromonas spp. önskas ska dessa analyser beställas separat i Cosmic.

 

Provtagning

Faeces i burk med sked utan tillsats, minst 2-3 skedar och max halva burken ska fyllas.

Provtagningsmaterial

    • Rör faeces med skopa 20ml S
      Art.nr: 15450

Provhantering

 Kyltransport. Prov hållbart i kyl 2-8°C i 5 dagar.

Svarsrutiner

Både positiva och negativa PCR-svar fås dagligen vardagar. Efter telefonkontakt med infektionsjour och därefter laboratoriet kan eventuellt svar fås på helgdag.

Shigella/EIEC odlas för vidare typning och resistensbestämning. 

EHEC skickas till NUS för stx1/2-typning (PCR) och odling. 

Vibrio odlas för typning. 

Yersinia enterocolitica odlas för vidare typning mellan patogena och ickepatogena Y. enterocolitica.

Salmonella odlas för typning och ev. resistensbestämning.

Odling kan utföras på begäran inom 2 vardagar på alla agens (förutom ETEC), till exempel när resistensbestämning är indicerat för inneliggande patienter.

Referensintervall/Beslutsgräns

Påvisad / Ej påvisad

Indikation

Infektiös diarré och buksmärtor, ibland med kräkningar och feber.

Medicinsk bakgrund/Tolkning

Interferens och felkällor

Korrekt provtagning är avgörande för analysresultatet, minst 2-3 skedar avföring måste finnas i provburken.
 
Transporttiden påverkar känsligheten vid odling, framför allt för Shigella, sensitiviteten sjunker vid långa transporttider (>24 timmar). 

Upprepad provtagning ger signifikant fler positiva fynd än enstaka prov. Utbytet beräknas vara 70-80 % vid varje provtagningstillfälle. Därför rekommenderas 2-3 prover per patient.

Metod

Realtids-PCR och odling på selektiva substrat, anrikning i buljong.

Ackrediterad

Ja

Sökord

FODL, faeces-odling, Campylobacter, diarré, gastroenterit, reaktiv-artrit, Salmonella, Shigella, Yersinia enterocolitica, EHEC, EIEC, Plesiomonas, kolera, Vibrio, cholerae, vulnificus, parahemolyticus, ETEC