Meningit/encefalit panel PCR
Utförande laboratorium
Mikrobiologiska laboratoriet, Sunderby sjukhus
Remiss
VAS i första hand (VAS-kod PANMEN) alternativt mikrobiologens pappersremiss.
Provtagning
Likvor i sterilt rör. Gärna >1 mL
Provhantering
Då provet är en akutanalys ska det omedelbart transporteras till laboratoriet och överräckas till personal på laboratoriet alternativt kontaktas laboratoriet om att provet är på väg. Behöver inte kyltransporteras.
För beställningar i efterhand kan provet anlyseras om det förvarats i rumstemperatur i max 1 dygn eller i kylskåp i max 7 dygn.
Svarsrutiner
Analysen utförs dagtid alla dagar i veckan. Elektroniskt svar till inremitterande samt ibland även telefon kontakt.
Referensintervall/Beslutsgräns
PÅVISAD /ej påvisad för respektive agens som ingår i analysen
Indikation
Misstanke om akut meningoencefalit.
Testet är inte avsett för användning på likvor insamlat via medicintekniska produkter, t.ex. shuntar.
Analysen ersätter inte odling, som alltid ska beställas samtidigt.
Medicinsk bakgrund/Tolkning
Nukleinsyrapåvisning för följande meningit- och encefalitpatogener:
Bakterier:
Streptococcus pneumoniae (pneumokocker)
Neisseria meningitidis (meningokocker)
Haemophilus influenzae
Listeria monocytogenes
Streptococcus agalactiae (grupp B streptokocker)
Escherichia coli (kapsel typ K1)
Virus:
Humant herpesvirus typ 1 och 2 (HSV-1 och HSV-2)
Varicella Zostervirus (VZV)
Enterovirus
Humant herpesvirus 6 (HHV-6)
Humant parechovirus
Cytomegalovirus (CMV)
Svampar:
Cryptococcus neoformans/gatti (kryptokocker)
För att nå högsta känslighet ska provet tas under de första sjukdomsdygnen med undantag för herpesvirus där man når maximal känslighet först 3 dygn in i sjukdomsförloppet varför upprepad testning kan vara befogat ifall testet initialt blev negativt. Negativt resultat utesluter inte förekomst av aktuella agens.
Interferens och felkällor
I testet ingår inte EBV (Epstein-Barr virus). Denna frågeställning skickas vidare till annat laboratorium..Testet har inte validerats på likvor från patienter utan symtom på meningit/encefalit eller på patienter med nedsatt immunförsvar. Testet är endast kvalitativ. Eftersom nukleinsyra kan kvarstå i flera veckor efter genomgången infektion kan svaret inte användas för att säga något om aktualiteten av påvisade fynd.
Metod
Snabb multiplex realtids-PCR (DNA/RNA) på FilmArray
Ackrediterad
Nej