Akut multiplex pneumonipanel PCR
Utförande laboratorium
Mikrobiologiska laboratoriet, Sunderby sjukhus
Remiss
Elektronisk remiss i första hand (VAS-kod PANPNE) alternativt mikrobiologens pappersremiss.
Provtagning
Bronkoalveolärt lavage, BAL, och mini-BAL, sputum och endotrakela aspirat. Skickas i tomt sterilt rör/burk.
Provtagningsvolymen bör vara minst 0,2 ml.
Provhantering
Då provet är en akutanalys ska det omedelbart transporteras till laboratoriet och överräckas till personal på laboratoriet alternativt kontaktas laboratoriet om att provet är på väg. Behöver inte kyltransporteras.
För beställningar i efterhand kan provet analyseras om det förvarats i kylskåp i max 1 dag.
Svarsrutiner
Analysen utförs dagtid vardagar kl 07.30-16.00. På dagtid helger utförs analysen endast för IVA-vårdade patienter kl 08.00-15.00. Elektroniskt svar till beställaren.
Referensintervall/Beslutsgräns
PÅVISAD / ej påvisad för respektive agens som ingår i analysen.
Indikation
Akut svår nedre luftvägsinfektion hos patient i behov av inneliggande vård.
Analysen är inte till för polikliniska utredningspatienter.
Analysen ersätter inte odling, som alltid ska beställas samtidigt. Odling är nödvändig för resistensbestämning, ev. ytterligare artbestämning samt detektion av bakterier som inte ingår i analysen.
Medicinsk bakgrund/Tolkning
Nukleinsyrapåvisning för följande agens.
Bakterier:
- Acinetobacter calcoaceticus-baumannii-komplex
- Enterobacter cloacae complex
- Escherichia coli
- Haemophilus influenzae
- Klebsiella aerogenes ( tidigare Enterobacter aerogenes)
- Klebsiella oxytoca
- Klebsiella pneumoniae-grupp (K. pneumoniae, K.quasipneumoniae, K.variicola)
- Moraxella catarrhalis
- Proteus spp.
- Pseudomonas aeruginosa
- Serratia marcescens
- Stafylococcus aureus
- Streptococcus agalactiae (GBS)
- Streptococcus pneumoniae
- Streptococcus pyogenes (GAS)
Atypiska bakterier:
- Chlamydophila pneumoniae
- Legionella pneumophila
- Mycoplasma pneumoniae
Virus:
- Adenovirus Coronavirus (229E, OC43,HKU1,NL63)
- Humant metapneumovirus
- Humant rhinovirus/enterovirus
- Influensa A och B
- Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)
- Parainfluensavirus (typ 1-4)
- Respiratoriskt syncytialvirus (RSV)
Interferens och felkällor
Med molekylär detektion får man bara svar på det som ingår i analysen. Eftersom nukleinsyra kan kvarstå i flera veckor efter genomgången infektion kan svaret inte användas för att säga något om aktualiteten av påvisade fynd.
Metod
Snabb multiplex realtids-PCR (DNA/RNA) på FilmArray
Ackrediterad
Nej